空き容量が少なくなり、ハードディスクが重たく感じるという人は多いようです。
別にファイルに質量があるわけではないので、重たくなるわけではないのはもちろんですが、動きが重たくなる原因にもなりません。
ハードディスクの回転にも影響しません。

要らないファイルを削除しても動きが軽くなるわけでもないし、デフラグの効果もそれほどありません。

遅くなる原因の中心は、ソフトウェアのインストールです。
何かを常駐させるソフトウェアが起動していないときも陰で何かをしているのです。
わかりやすいのは、ウイルス対策ソフトです。
安全のためネットワークを切ってからウイルス対策ソフトの動作を止めるとよく分かります。
動きが軽快になります。しかし、ウイルスの感染の心配があるので、止めるわけにいきません。
そういう場合は、動作が軽いものと入れ替えることでしょう。